一、透析的原理
透析只需要使用專用的半透膜即可完成。通常是將半透膜制成袋狀，將生物大分子樣品溶液置入袋內，將此透析袋浸入水或緩沖液中，樣品溶液中大分子量的生物分子被截留在袋內，而鹽和小分子物質不斷擴散透析到袋外，直到袋內外兩邊的濃度達到平衡為止。保留在透析袋內未透析出的樣品溶液稱為“保留液"，袋（膜）外的溶液稱為“滲出液"或“透析液"。
透析的動力是擴散壓，擴散壓是由橫跨膜兩邊的濃度梯度形成的。透析的速度反比于膜的厚度，正比于欲透析的小分子溶質在膜內外兩邊的濃度梯度，還正比于膜的面積和溫度，通常是4℃透析，升高溫度可加快透析速度。
二、透析的過程
1）把適量的透析液（緩沖液）加入透析裝置。透析液的體積應為樣品體積量的100倍。（例如，在1L透析液中透析10ml的樣品）
2）裁剪適當長度的透析管。預留一段額外長度（約占總樣品體積量的20%）作為頭部空間。
3）把透析管插入打開的透析夾，在約超出透析夾3-5mm的位置再夾住。不要折疊透析袋。
4）由透析管開口端將樣品裝入。調整一下頂部空間的長度，夾緊透析夾。
5）把透析樣品放在合適的透析緩沖液中。
6）透析要根據具體的應用需求。通常情況下，允許過夜透析。在持續透析的過程中，至少要進行3次全部更換透析液。建議在（透析后）2-4小時，6-8小時和10-14小時（第二天早晨）更換透析液。在最后一次透析液的更換后，要至少繼續進行2小時的透析。
注意：對于高濃度污染物，樣品可能需要較長的時間透析，透析液需要更頻繁的更換。
7）透析溫度主要取決于樣品。溫度最高限制主要取決于膜的類型。纖維素透析袋可以承受的溫度高達37℃。再生纖維素透析袋可以承受的溫度高達60℃。
三、透析袋的材質與規格
透析膜可用動物膜和玻璃紙等，但用的最多的還是用纖維素（再生纖維素 RC、纖維素酯CE、PVDF等）制成的透析膜，目前常用的是美國光譜醫學公司（spectrum）和美國聯合碳化物公司（union carbide）生產的各種尺寸的透析管。截留分子量MwCO（即留在透析袋內的生物大分子的最小分子量，縮寫為MwCO）大概有100、500、1000、2000、3500、8000、10000、15000、20000、25000、50000、100000、250000、500000、1000000等種類，單位為道爾頓（D）。截留分子量越大也就是說透過性越大，一般而言，透析袋截留分子量越小價格越貴，因為截留的分子越小要求透析袋越密，價格越貴。商品透析袋制成管狀，其扁平寬度為8mm-77mm不等。
半透膜制成的透析袋作為工具，存在透析時間長、樣品回收率不高、無法處理微量樣品的難題。目前已有專為10到100ul的微量樣品透析而設計的透析工具。把樣品加在平底的透析管（類似小量提質粒的離心純化柱，可以插入1.5ml的離心管中，管底是半透膜）中，再插入特制的浮板（浮漂）中，置于緩沖液面10min即完成透析。實驗表明，100ul pH2.8的IgG洗脫液在1L pH9.4的緩沖液中只需不到10min即可平衡到pH9.4。如果在裝緩沖液的燒杯底加磁力棒攪拌則更能加速透析速度。這種方法有較高的回收率，能夠節約珍貴的樣品，并能節約時間，特別適合摸條件的預實驗。
透析袋的標識：
1）27mm（MD34）透析袋（MW：3500）
27mm是指透析袋干燥時的直徑。
MD34mm是指透析袋干燥時壓平的寬度。
MW：3500是指透析袋的截留分子量。
2）選擇適合的透析膜材質
每種膜對不同的分子具有不同的親和性。對于球蛋白，相對的結合親和性由低到高為CE＜RC＜PVDF。
透析袋使用前的處理
為防干裂，出廠前透析袋一般都經10%的甘油處理，透析袋中含有微量的硫化物、重金屬和一些具有紫外吸收的雜質，它們對蛋白質和其他生物活性物質有害，用前必須除去。新購進的普通型透析袋必須經過處理才能使用。處理方法如下。
方法一：
把透析袋剪成適當長度（10-20cm）的小段。
在大體積（500ml）的2%（w/v）的碳酸氫鈉和1mmol/L EDTA2Na（pH=8.0）中將透析袋煮沸10min。
用蒸餾水清洗透析袋。
放在500ml的1mmol/L EDTA2Na（pH=8.0）中將之煮沸10min。
冷卻后，置于30%或者50%的酒精中，放于4℃冰箱，必須確保透析袋始終浸沒在溶液內。從此時其取用透析袋必須戴手套。
在使用前要用蒸餾水將透析袋里外加以清洗干凈。
方法二：
可先用50%乙醇煮沸1h，再依次用50%乙醇、0.01mol/L碳酸氫鈉和1mmol/L EDTA（pH=8.0）溶液洗滌，最后用蒸餾水沖洗即可使用。
方法三：
實驗要求不高的可以用簡易方法處理。用沸水煮5至10min，再用蒸餾水洗凈，即可使用。
不過現在也有雜質含量極少，無需預處理，只需用去離子水清洗即可使用的即用型透析袋。這種透析袋具有特殊的生物技術膜，不含硫化物及金屬雜質。只是比普通型透析袋稍貴。
3)透析袋濃縮樣品
大多數情況下，透析袋純化的樣品會被稀釋。如果下游需要的樣品濃度比較高時，可能需要對樣品進行濃縮。透析袋本身濃縮的方法如下。
(1）吹干濃縮法： 將蛋白溶液裝入透析袋內，放在電風扇下吹。此法簡單，但速度慢，且溫度不能過高，最好不要超過15℃。
(2）透析袋濃縮法： 利用透析袋濃縮蛋白質溶液是應用的一種。將要濃縮的蛋白溶液放入透析袋（無透析袋可用玻璃紙代替），結扎，把高分子（6000-12000）聚合物如聚乙二醇（碳蠟）、聚乙烯吡咯、烷酮等或蔗糖撒在透析袋外即可。也可將吸水劑配成30%-40%濃度的溶液，將裝有蛋白液的透析袋放入即可。吸水劑用過后，可放入溫箱中烘干或自然干燥后，仍可再用。
主要用于更換蛋白質的緩沖液，得有透析袋。不需要特殊的儀器。一般用得是PEG20000進行實驗，簡單，快速，對蛋白沒什么影響。
此外，還有其他的樣品濃縮方法，如冷凍干燥濃縮法、超濾膜濃縮法等。
